Євген народився 24 липня 1981 року в місті Верхівцеве на Дніпропетровщині. Закінчив Коледж академії митної служби (який реорганізовано в Університет митної справи та фінансів) у Дніпрі за спеціальністю «Електронні системи та технології».
Працював учителем інформатики, згодом займався продажами. Останнім часом мав невеликий бізнес з продажу електротоварів і дитячих іграшок. Мешкав у Дніпрі. Цікавився психологією, любив подорожувати автомобілем містами України. Найбільше цінував час із родиною.
Під час повномасштабного вторгнення служив у Військово-морських силах Збройних Сил України. Обіймав посаду старшого навідника гармати в 406-й окремій артилерійській бригаді імені генерал-хорунжого Олексія Алмазова. Мав статус ветерана війни.
«Дбайливий, люблячий батько і чоловік, дуже добра людина. Обожнював доньок і робив все можливе для їхнього майбутнього та безпеки. Це непоправна втрата для сім’ї», – написала дружина Світлана.
Поховали Євгена Прокопенка в Дніпрі на Краснопільському кладовищі.
У нього залишилися дружина і дві доньки.
